（一）苯環上取代基的影響
吩噻嗪苯環上取代基的位置和性質對抗精神病活性及強度都有密切關系。1、3和4位有取代基時活性均會降低，只有2位引入吸電子基團可增強活性。當氯丙嗪的2位氯被吸電子作用更強的氟甲基取代時，抗精神病活性增強，如三氟丙嗪抗精神病活性為氯丙嗪的4倍。2位取代基增強抗精神病的作用強度與其吸電子性能成正比，對活性大小的影響是CF3>Cl>COCH3>H>OH。2位乙酰基取代可降低藥物的毒性和副作用，乙酰丙嗪雖然作用弱于氯丙嗪，但毒性亦較低，2位乙酰基取代的乙酰奮乃靜，帕金森副作用比奮乃靜低。
（二）苯環2位以硫取代，可降低錐體外系副作用
當2位為硫原予取代時，鎮靜作用增強，而錐體外系副作用減輕。錐體外系副作用是抗精神病藥物最常見的一種副作用，發生率約為25%-60%。副作用產生的原因主要是阻斷了運動神經的多巴胺受體。硫利達嗪的錐體外系副作用很弱，主要用于治療精神分裂癥，此外還具有較強的降血壓作用。2位含S取代基的結構還有硫乙拉嗪、哌泊噻嗪等，對慢性精神病人有明顯的改善作用。
（三）吩噻嗪10位氮原子上的取代基對活性的影響
側鏈末端的取代基為含N的堿性基閉，由于堿性基團與受體中一個狹窄的凹槽相匹配，取代縫的寬度對活性的影響很大。堿性基團常為叔胺，可為脂肪叔胺基，如二甲氨基，也可為氮雜環，常用哌啶基或哌嗪基。以哌嗪取代的側鏈作用最強，以羥乙基哌嗪取代的奮乃靜、氟奮乃靜，以甲基哌嗪取代的三氟拉嗪的活性都要比氯丙嗪強十幾倍到幾十倍。若以哌啶衍生物取代，也得到療效較好的藥物如硫利達嗪、哌泊噻嗪。側鏈的結構還與副作用有一定關系，側鏈為脂肪胺，如氯丙嗪具有中等錐體外系副作用；側鏈為哌啶，如硫利達嗪嗪錐體外系副作用較小。
（四）吩噻嗪10位氮原子到側鏈氮原子的距離對活性的影響
當10位N原子與側鏈堿性胺基之間相隔3個直鏈碳原子時作用最強，是吩噻嗪類抗精神病藥的基本結構，碳鏈延長或縮短，或出現分支，都將導致抗精神病作用的減弱或消失。
（五）修飾成前藥可延長作用時間
氟奮乃靜的作用強，但作用時間只能維持一天，利用其側鏈上的伯醇基，制備長鏈脂肪酸酯類的前藥，前藥在注射部位貯存并緩慢釋放出氟奮乃靜，可使藥物維持作用時間延長。如庚氟奮乃靜及癸氟奮乃靜，前者注射一次可維持作用1-2周，后者可維持作用2-3周。這種前藥的修飾方法還適用于其他N上有羥乙基哌嗪取代的抗精神病藥物，脂肪酸的碳鏈越長，作用時間越長，如棕櫚哌泊噻嗪長達每月注射一次。
（六）吩噻嗪三環用各種生物由子等排體替代時，也具有治療精神病作用，由此發展了硫雜蒽類的抗精神病藥物及其他三環類的抗抑郁藥 [1] 。