厭氧菌合并其他病原體感染可有厭氧菌感染的臨床特征如咳膿臭痰。其他類型的多重感染缺少特征性癥狀。一般而言，多重感染患者癥狀更嚴重。
多重肺部感染盡管臨床上相當常見，但確診甚為困難，一是因為某些病原體如病毒等實驗室診斷技術不能適應臨床需要；二是由于下呼吸道標本采集困難，上呼吸道和口腔存在大量定植菌，而在長期住院或抗菌治療過程中其菌群經常變化，經口咳痰標本易遭污染，培養有多種細菌生長不表示真正存在多重感染，相反培養無菌生長或單一細菌生長并不能排除多重感染。
臨床上凡有上述好發多重感染的病種和危險因素或者中重度肺部感染經規范的抗生素治療無效的患者都應該提高警覺，考慮到多重感染的可能。肺膿腫和支氣管擴張癥常見厭氧菌和需氧菌混合感染，如果臨床癥狀典型，便可按多重感染處理。在其他類型肺炎其多重感染包括二重感染的診斷需要確切的病原學證據。血液和胸液標本培養結果最具診斷價值，下呼吸道防污染或支氣管肺泡灌洗標本需要結合定量培養。咳痰經過篩選，取合格標本培養，若兩種或兩種以上細菌是優勢生長均達到106CFUml，有重要參考價值。條件致病性真菌亦需從下呼吸道應用防污染技術進行采樣，口痰標本培養結果無意義。病毒檢測因培養困難，血清免疫學和分子生物學技術有參考價值。病理組織學檢查對銅綠假單胞菌肺炎和某些特殊病原體感染(真菌、卡氏肺孢子蟲、分枝桿菌)結合特殊染色有重要診斷價值。
咳痰經過篩選，取合格標本培養，若兩種或兩種以上細菌是優勢生長均達到106CFUml，有重要參考價值。X線病變范圍更廣泛，壞死性肺炎更常見。