子宮腺肌病病因至今不明。目前的共識是因為子宮缺乏黏膜下層，因此子宮內膜的基底層細胞增生、侵襲到子宮肌層，并伴以周圍的肌層細胞代償性肥大增生而形成了病變。
中醫認為本病由氣滯、寒凝、熱灼、氣虛、腎虛導致瘀血阻滯沖任、胞宮，經行不暢則痛經。瘀血阻滯沖任、胞宮為主要病機。
