1.人類乳頭狀瘤病毒感染
近年來隨著人類乳頭狀瘤病毒（HPV）感染與下生殖道關系研究的不斷深入，發現HPV感染與子宮頸癌前病變的發生有著一定的關聯。HPV感染作為一種特殊類型的性傳播疾病，是子宮頸上皮內瘤樣病變和宮頸癌發生的病因。分子生物學及流行病學研究表明人類乳頭狀瘤病毒有致癌性。HPV根據其致癌性不同可分為不同類型：HPV16，18，45，56為高危型，HPV31，33，35等11種為中危型，HPV6，11，26等8種為低危型。CINⅠ及亞臨床HPV感染常為HPV6、11型，80%CINⅢ為HPV16型感染。
子宮頸重度不典型增生者，其細胞內染色體常伴有HPV基因的整合，從而啟動E1、E2基因，導致病毒基因在宮頸上皮內的表達，其后E6、E7基因編碼合成多功能蛋白從而干擾細胞生長，在16、18型高危HPV感染的患者中起著重要的致癌作用。高危型HPV的E6蛋白可與腫瘤抑制基因p53結合，導致p53降解，E7基因產物是一種核磷酸蛋白與腫瘤抑制基因（retinoblastoma基因PRb）產物結合導致其功能滅活，從而影響其抑制細胞生長的作用。
2.其他因素
（1）吸煙 吸煙與宮頸上皮內瘤樣病變的發生有一定關系，其降解物尼古丁與致肺癌類似的刺激性，在宮頸上皮內瘤樣病變的發生中起重要作用。
（2）微生物感染 淋球菌、單純皰疹病毒（HSV）、滴蟲感染可增加對HPV的易感性，從而與宮頸上皮內瘤樣病變的發生有關。
（3）內源性與外源性免疫缺陷 免疫缺陷病毒的感染可致CIN的發生增加，如Hodgkin病、白血病、膠原性血管病與HPV感染性疾病發生有關。