寡聚核苷酸連結分析:寡核核苷酸,無論是DNA的或者RNA的,都有形成雙鏈結構的潛在可能性,正如下面反復提到的,這種結構對寡核苷酸的作用有很大影響。所以,預測這種結構的穩定性對設計和優化寡核苷酸就很重要。在一個雙鏈結構中,堿基對的相對穩定性是由其鄰近堿基決定的。