近年在病理與生理學研究方面的新進展較多，文獻報道顯示解剖結構形態、神經支配與功能以及炎癥因素都與喉軟化癥的形成密切相關，“Ω”結構的會厭只有在病理基礎存在時，才可能產生致病作用。
解剖學因素
關于解剖學因素，下列解剖結構異常是重要的相關因素：杓會厭皺襞向內塌陷、楔形軟骨擴大；軟化或過長的管狀會厭結構；杓狀軟骨的向前、向內塌陷；吸氣時會厭向后接觸咽后壁或向內塌陷接觸聲帶；杓會厭襞過短，楔狀軟骨和小角軟骨向前塌陷。
神經肌因素
神經肌肉功能不全或缺陷是另一個可能的核心病理生理機制，莖突咽肌、腭咽肌、舌骨舌肌和二腹肌協調運動起到擴張聲門上結構的作用。繼發于神經肌肉功能失調的肌張力低下，導致喉喘鳴和不同程度的氣道阻塞與呼吸困難。
炎癥因素
文獻提及胃食道反流與喉軟化癥密切相關。由于聲門上結構向內塌陷引起的吸氣時胸腔負壓增加，增加胃內容物向食道內的反流，同時加重聲門上結構后壁的水腫，繼發喉軟化癥。這一現象可能是為什么新生兒出生后沒有喉軟化癥癥狀的注釋。這些水腫的黏膜再吸氣相時向聲門內塌陷，但其因果關系尚難以確定。傳統觀點認為喉軟骨發育不成熟導致軟化在吸氣時向內塌陷的傾向，然而該假說無法解釋在早產兒中喉軟化癥的發生率并沒有升高的現象。同時，缺乏至關重要的組織學異常的證據。