1.血液檢查 急性腎盂腎炎常有血白細胞總數和中性粒細胞比例明顯增高、血沉增快、C反應蛋白＞20mg/L。膀胱炎時上述實驗指標多正常。
2.尿常規檢查 清潔中段尿離心鏡檢中白細胞≥5個/Hp提示尿路感染，若見白細胞管型，提示腎盂腎炎。腎乳頭或膀胱炎可有明顯血尿。尿路炎癥嚴重者，可有短暫明顯的蛋白尿。部分病兒可有血尿或終末血尿。
3.細菌學檢查 尿培養是確定診斷的重要證據，要求在抗生素應用前做，排尿前勿多飲水。留尿過程中要嚴格按常規操作以免尿液污染。尿培養因可受前尿道和尿道周圍雜菌的污染，故需在治療前做清潔中段尿培養及菌落計數，若菌落計數≥10萬個/ml有診斷意義，1萬～10萬個/ml為可疑。但已有膀胱炎尿路刺激癥狀的患者，尿白細胞明顯增多，尿培養菌落計數為1000～1萬個/ml亦應考慮尿感的診斷，此外，某些革蘭陽性球菌如腸鏈球菌分裂慢，如為1000個/ml亦可診斷尿感。對嬰幼兒和新生兒以及懷疑尿感而留尿困難的小兒，可做恥骨上膀胱穿刺培養，陽性培養即有診斷意義。留做細菌培養的尿若不能及時送驗時，應暫放4℃冰箱內，否則會影響結果。有發熱的尿感應同時做血培養。大量利尿或已應用抗菌治療，則影響尿培養的結果。送尿培養如培養陽性應做藥物敏感試驗，指導治療。
4.尿直接涂片找細菌 用一滴均勻新鮮尿液置玻片上烘干，用亞甲藍或革蘭染色，在高倍或油鏡下每視野若見到細菌≥1個，表示尿內菌落計數＞10萬個/ml。根據尿沉渣涂片革蘭染色及細菌形態可作為選用藥物治療的參考。
5.菌尿輔助檢查 尿液亞硝酸鹽還原試驗，可作為過篩檢查，陽性率可達80%。
6.其他檢查 腎小管損傷的其他實驗室指標，尿β2-mG，尿N-乙酰-β-D-葡萄糖苷酶(NAG)增高，尿滲透壓降低提示腎盂腎炎。