血清甲胎蛋白的檢測對肝癌的診斷極為重要。90%～100%為陽性，比成人病例更高（成人為70%～80%陽性）。許多生物化學物質如蛋白、脂質、酶等皆由肝臟產生或在肝臟中進行代謝，故血膽固醇、乳酸脫氫酶（LDH）、白蛋白、球蛋白、堿性磷酸酶、膽紅質等檢查均能反映肝臟功能，均屬必要。血清堿性磷酸酶常增高，這對肝癌的診斷亦頗有幫助。超聲波檢查、核素肝掃描對本病診斷均有幫助。CT、MRI（磁共振影像診斷）對診斷均有參考價值。
