病因尚未明確，細菌或病毒感染的患者在感染期間或感染以后常發生全血細胞減少，細菌或病毒感染的患者也常應用抗生素和其他藥物治療，因此，難以明確再障是感染、藥物引起的還是二者共同作用的結果，甚至有時感染性疾病是全血細胞減少引起的，而不是病因。
