阻塞性睡眠呼吸暫停應與中樞性睡眠呼吸暫停鑒別，中樞性睡眠呼吸暫停可見于多種疾患：
1.神經系統病變
如脊髓前側切斷術，血管栓塞或變性病變引起的雙側后側脊髓的病變，腦脊髓的異常，如枕骨大孔發育畸形，脊髓灰質炎，外側延髓綜合征，自主神經功能異常：如家族性自主神經異常，胰島素相關的糖尿病，Shy-Drager綜合征，腦炎，腦干腫瘤。
2.肌肉病變
如膈肌病變，肌強直性營養不良肌病等。
3.其他
某些肥胖者，充血性心力衰竭等。
