1.X線平片檢查：頭顱X線平片是一項常規檢查。耳源性小腦膿腫可發現中耳炎、乳突炎和常常并發的膽脂瘤所引起的顳巖骨骨質破壞和乳突氣房消失等改變。
2.超聲檢查：超聲檢查對小腦膿腫常可測出腦室擴大。此項檢查僅供參考。檢查結果陰性也不能完全除外小腦膿腫。
3.腰椎穿刺檢查：腰椎穿刺檢查對小腦膿腫的診斷價值較大。小腦膿腫的早期腦壓稍增高。腦脊液中白細胞增多，一般在0.05～0.10×10/L（50～100個/mm）。在伴隨有化膿性腦膜炎時，白細胞計數較高。當膿腫形成后，腦壓較高，而白細胞計數正常或以淋巴細胞增多為主，腦脊液蛋白含量大多增加至1.0～2.0g/L或更高。當膿腫接近腦表面或腦室時，蛋白增加較明顯。腦脊液中糖和氯化物大多正常。此外，腦脊液中淋巴細胞增多而細胞總數少，蛋白量增加，這種細胞蛋白分離現象對膿腫的診斷有一定意義。
當腦疝形成或行將發生腦疝時，可使椎管發生一定程度的阻塞。由于腦壓不能下傳到脊髓腔，因此腦壓正常也不能除外腦膿腫的診斷。
4.椎動脈造影檢查：此檢查對小腦膿腫定位診斷有幫助，可顯示小腦后下動脈拉直和向對側移位，基底動脈向前彎曲，大腦后動脈和小腦上動脈向上移位。腦室造影目前已較少應用。
5.骨錐鉆孔抽膿：如結合臨床病史、體征、X線等檢查結果，高度懷疑耳源性小腦膿腫存在時，可在枕下施行鉆顱穿刺抽膿。如抽得膿液，既可明確診斷，同時又可進行沖洗和注入抗生素，具有治療作用。國內許多單位報告采用此法的優越性，使病人及時診斷和獲得治療，死亡率大大降低。值得注意的是，穿刺陰性仍不能完全除外腦膿腫。
6.頭顱CT掃描：CT應用于臨床，使顱內疾病的診斷有了重大突破，對顱內化膿性病變的診斷率亦有提高。在腦膿腫時有特征性改變，即膿腫周圍顯示高密度環影帶和中心部低密度改變，并能精確地顯示多發性和多房膿腫及膿腫周圍腦水腫的程度，為手術治療提供參考依據。