(1)曾有報道慶大霉素全身應用合并鞘內注射時引起腿部抽搐、皮疹、發熱和全身痙攣等。慶大霉素引起腎功能減退的發生率較妥布霉素為高。
(2)發生率較多者有聽力減退、耳鳴或耳部飽滿感(耳毒性)、血尿、排尿次數顯著減少或尿量減少、食欲減退、極度口渴(腎毒性)、步履不穩、眩暈(耳毒性，影響前庭；腎毒性)。發生率較低者有呼吸困難、嗜睡、極度軟弱無力(神經肌肉阻滯或腎毒性)。
(3)停藥后如發生聽力減退、耳鳴或耳部飽滿感，需引起注意。不良反應與卡那霉素進近似，用量小時反應較輕.如用量大，療程長，偶見腸道菌群紊亂，一旦出現即停藥，可恢復正常.可有白細胞減少，聽力及腎損害.個別病例口周、面部和四肢皮膚發麻，眩暈,耳鳴.偶有過敏性休克，主要癥狀為呼吸道阻塞及循環障礙、半數以上病例經搶救無效而死亡，故有人認為該品的最嚴重的不良反應為速發型過敏性休克.可引起羅姆伯格氏癥(閉目難立，暗處和洗臉時站不穩)中毒癥狀。