微衛星標記(microsatellite),又被稱為短串聯重復序列(short tandem repeats,STRs)或簡單重復序列(simple sequence repeats,SSR),是均勻分布于真核生物基因組中的簡單重復序列,由2~6個核苷酸的串聯重復片段構成,由于重復單位的重復次數在個體間呈高度變異性并且數量豐富,因此微衛星標記的應用非常廣泛。微衛星位點通常通過PCR擴增,擴增產物通過電泳分析并根據大小分離等位基因進行檢測。