慢性盆腔疼痛應與盆腔癌性疼痛相鑒別。慢性不定位性疼痛還應考慮其他與婦科無關的疾病，如結核性腹膜炎、腸粘連、腸道蛔蟲癥和神經官能癥等疾病。
心理性慢性盆腔疼痛應與器質性下腹部疼痛相鑒別：器質性下腹部疼痛為銳痛、痙攣性、間歇性、可發生于任何時間、睡眠時可因疼痛而覺醒、沿神經分布途徑放射、有典型壓痛點、發展或很快好轉或更加劇烈、在手法檢查后產生或加劇、不受情緒影響。心理性盆腔痛為鈍痛、持續性發作、往往在覺醒后疼痛、遇有社會心理因素時發作、疼痛部位與神經分布不一致、無放射痛、呈轉移改變及彌漫性、長年累月維持同樣的疼痛、檢查后不會觸發或增加疼痛、處理人際關系不當時即會發生。