治療按不同病程分別處理。緩解期無心、肺功能衰竭者以治療肺部慢性疾患為主。呼吸體操著重鍛煉腹式呼吸、膈運動。急性功能失代償期以控制感染和糾正心、肺功能衰竭為主。多數右心衰竭患者經控制感染、改善呼吸功能后，心功能不全亦隨之緩解。部分病人仍需使用利尿劑和(或)強心劑，但須注意電解質紊亂、心律不齊和血濃縮的出現，及時予以糾正。慢性肺心病心力衰竭對洋地黃治療非但作用不大，且易引起中毒。約有20～35%慢性肺心病患者出現心律失常，如異位起搏點。洋地黃中毒、缺鉀、缺氧、酸中毒以及迷走神經興奮等常是心律失常的誘因。肺心病心律失常時以治療病因為主，而不宜過多投予各種抗心律失常藥物。