亞急性和慢性腦膜炎可見于真菌感染,結核病,萊姆病,艾滋病,梅毒或一些非感染性疾病如肉樣瘤病,貝切特綜合征以及新生物---例如白血病,淋巴瘤,黑色素瘤,腦部轉移癌以及膠質瘤(特別是成膠質細胞瘤,室管膜瘤和髓母細胞瘤).亞急性腦膜炎也可由于某些鞘內注射引起的化學反應所造成.慢性腦膜炎必須與恢復過程較為延長的急性腦膜炎或腦炎有所鑒別,還必須與復發性腦膜炎(例如,見于顱咽管瘤滲漏或頭部外傷后)區別.。
