慢性腹痛按其傳入神經及臨床表現分為4種類型，即軀體性疼痛、內臟性疼痛、牽涉性疼痛、精神性疼痛。
軀體性疼痛
指通過脊神經傳導的疼痛，腹壁、壁層腹膜和腸系膜根部均由中樞抻經系統支配，由脊神經傳導，當內臟病變累及腹膜壁層或腸系膜根部時則引起持續性疼痛。由于腹腔壁層腹膜的痛覺神經纖維豐富，敏感性強，故當其受到刺激后，不僅疼痛劇烈，而且定位準確。膈中央部位受刺激后，痛覺則由膈神經傳導，并向頸部和肩部放射而發生牽扯痛。[2]
臟性疼痛
腹腔內臟器和腹腔臟層腹膜由自主神經系統支配，自主神經即為內臟神經，由交感神經和副交感神經組成，分別含有傳入和傳出纖維。當腹部內臟的傳入神經通過后神經根到達脊髓時，不但與內臟傳出神經組成反射弧，而且也可與體干神經接觸。在同一脊髓內，可能接受腹部若干不同內臟的感覺。腹部內臟由內臟神經支配，對一般的和輕微的刺激感覺遲鈍，識別和定位能力都比較模糊，只有當器官黏膜受到炎癥、充血或缺血刺激、肌層擴張或痙攣以及腸系膜受到牽拉時才會引起疼痛。
牽涉性疼痛
牽涉性疼痛指內臟性疼痛牽涉到身體體表部位，軀體性和內臟性疼痛都可以產生牽涉性疼痛。對牽涉性疼痛的機制目前有兩種看法：一種認為脊髓或中樞中間神經元會聚了軀體和內臟傳人的痛覺沖動，內臟病變增加了傳人沖動的數量及頻率，形成“興奮灶”，激化來自皮膚進入同一節段的神經沖動，使正常情況下皮膚傳人的閾下刺激變為有效的闕上刺激，結果誤認為內臟疼痛為體表疼痛。另一種認為有些背根神經節細胞外周軸突是分叉的，同時支配同一階段來源的皮膚和內臟器官。內臟疾病產生的強傳人沖動經軸突分叉逆行傳導至該分支可支配的皮膚區，釋放P物質，使血管擴張，痛覺過敏。
牽涉性疼痛定位明確。其部位由病變器官的神經所支配的區域來決定，可同時出現局部皮膚、肌肉痛覺過敏、腹肌緊張和腹膜刺激征，局部麻醉可消除放射痛。常見內臟疾病牽涉性疼痛的定位對腹痛的鑒別診斷有參考價值。例如膽囊疾病除右上腹疼痛外常有右肩胛下疼痛，腎結石除有同側腰痛外，有該側大腿內側及會陰部疼痛，闌尾炎由上腹部或臍區疼痛轉移至右下腹。
精神性疼痛
常由于精神受刺激而誘發，各項檢查均無器質性病變證據。心理因素是腹痛的重要發病基礎，腹痛特點為突發突止，劇痛，部位不固定，伴有焦慮、恐懼、失眠或癔癥性表現。