1.小細胞成骨源性肉瘤 在16例Mayo Clinic的患者中，其累積5年生存率只有28.9%。
2.高度惡性骨表面成骨源性肉瘤 組織學表現和預后類似于傳統型成骨源性肉瘤。
3.骨膜成骨源性肉瘤 通過恰當的手術治療其預后優于傳統型成骨源性肉瘤。
4.低度惡性中央型成骨源性肉瘤 比傳統型成骨源性肉瘤的預后好得多。
5.血管擴張型成骨源性肉瘤的治療和預后與傳統型成骨源性肉瘤相似。
6.皮質旁成骨源性肉瘤是一種低度惡性的成骨源性肉瘤亞型，預后非常好。如果得到充分恰當的治療，80%以上的患者能夠存活。偶爾，腫瘤發生局部復發后，組織學和細胞學上的不典型性會較初發時更明顯。
傳統的治療方法（截肢、放療）成骨源性肉瘤的預后差，5年存活率不超過20%。
影響成骨源性肉瘤患者預后的因素最重要的是腫瘤組織對化療藥物的反應程度，即化療后腫瘤細胞的壞死率，壞死率小于90%者，即使改變化療方案預后亦不良。有學者報道，腫瘤的大小（體積大于150mm3者預后不良），以及術前堿性磷酸酶、乳酸脫氫酶的水平高低對預后判斷亦有重要意義。
對于沒有發生肺轉移的成骨源性肉瘤，通過術前、術后的化療和適當的外科治療，其治愈率國外的治療結果可高達60%～80%。
在國內治療的成骨源性肉瘤，5年治愈率為52%，60%的病人做了保肢手術，保肢術的復發率為12.5%。