散在發生時，須與皰疹性咽頰炎、風疹等鑒別：
1.單純皰疹性口炎
四季均可發病，由單純皰疹病毒引起，以散發病例為主。口腔黏膜出現皰疹及潰瘍。但沒有手、足部皰疹。
2.皰疹性咽頰炎
主要由柯薩奇病毒引起，患兒發熱、咽痛，口腔黏膜出現散在灰白色皰疹，周圍有紅，皰疹破潰形成潰瘍。病變在口腔后部；如扁桃體前部、軟腭、懸雍垂，很少累及頰黏膜、舌、齦。不典型的患兒須做病原學及血清檢查。
