摩根菌,為腸桿菌科摩根菌屬。由Morgan于1906年發現。過去稱摩根變形桿菌。在自然界,廣泛分布,常存在于人及動物的腸道內。近幾年來,隨著生物學的發展,通過對其DNA研究,發現摩根變形桿菌DNA分子中的鳥嘌呤和胞嘧啶含量明顯高于其他變形桿菌。故現已單獨分出來,稱為摩根菌屬。現已發現的有:摩根菌和摩根菌生物群。