1.母-嬰垂直感染
新生兒AIDS的發病和孕母有密切關系，因嬰兒AIDS中相當一部分是通過母-嬰垂直傳播而獲得。
2.母-嬰水平感染
新生兒生后可通過感染了AIDS病原體的母親的乳汁而受染。
3.醫源性感染
（1）輸血與血制品感染：Ammann等（1983）報告1例生后幾天內反復接受輸血與血制品的新生兒于生后6個月時出現AIDS癥狀，并無CMV、HDV及EBV感染的證據，經對供血員調查后發現，其中1名在供血后7個月發生AIDS，推測供血員系病原體攜帶者且表明血制品的輸入或輸血可傳播AIDS。
（2）注射器及針頭感染：新生兒、嬰兒還可因多次靜脈注射經注射器及針頭等方式受染。