與甲氨蝶呤的不良反應相似，有口腔炎、胃炎、食欲減退、惡心、嘔吐，嚴重時可出現全消化道潰瘍、便血；亦可出現白細胞、血小板減少、骨髓巨幼變、中毒性肝炎、脫發、皮炎、色素沉著；妊娠早期可致畸胎，少數患者可出現月經延遲或生殖機能減退等；因對中樞神經系統毒性較大，目前已少用或不用。
