水泡性口炎的病原為水泡性口炎病毒(VSV)。分類上屬彈狀病毒科、水泡病毒屬。有關病原的理化特性、生物學特性及與之相關病毒的對比見“豬水泡病”。
水泡性口炎有兩個獨立的血清型，即新澤西型(NJ，初次分離鑒定于1926年)和印地安那型(IND，初次分離鑒定于1925年)。后者又有三個亞型，它們是印地安那Ⅰ型(IND-Ⅰ，為典型株)、印地安那Ⅱ型(IND-Ⅱ，包括Cocal株和Argentina株)和印地安那Ⅲ型(IND-Ⅲ，Brazil株)。后二個亞型對豬、牛、馬的致病力要低于NJ和IND-Ⅰ型。盡管NJ型和IND型在血清學和免疫學上是相互獨立的，但在臨診癥狀上區別不開。刺激機體產生特異性體液免疫的是病毒糖蛋白，具有補反活性的抗原是病毒的核蛋白。
VSV感染的細胞培養物可產生血凝素，在0-4℃、pH6.2的條件下凝集鵝紅細胞，病毒不會從紅細胞表面自行脫落。VSV在細胞培養物中生成血凝素的適宜條件與狂犬病病毒相似，即細胞維持液內不含血清，但加0.4%牛血清白蛋白。
序列分析表明，VSV基因組是一個單一的負鏈。在病毒進入易感細胞漿的過程中，基因組借助于結合在病毒子上的多聚酶轉錄為mRNA，mRNA又可翻譯產生5種蛋白：L蛋白(MW200000)與NS核心蛋白(MW25000)一起構成病毒多聚酶；G蛋白(MW57000)是一種糖基化的膜蛋白；M蛋白(MW26000)是未糖基化的膜蛋白；N蛋白(MW47000)為核蛋白。病毒在胞漿中復制，經細胞膜芽生而成熟。VSV在細胞培養物中能復制很高的病毒滴度，而且在這個過程中產生很高的干擾素滴度。 [2]
VS主要發生在西半球。NJ型和IN-I型的流行區包括美國、墨西哥、巴拿馬、委內瑞拉、哥倫比亞、厄瓜多爾和秘魯。波利維亞和加拿大只有NJ型。法國和南非也曾有過報道。我國湖北省宜昌和秭歸縣于九十年代初曾發生豬的VS，但未定型。本病主要使豬和乳牛的生產能力下降而造成嚴重的經濟損失。