漢坦病毒可兩種：引起漢坦病毒肺綜合征（HPS），另一種引起漢坦病毒腎綜合征出血熱（HFRS）。前者主要流行于美國，在阿根廷、巴西、巴拉圭、玻利維亞以及德國也發現了病例。
漢坦病毒包括引起腎綜合征出血熱（HFRS）的漢坦病毒（Hantaan virus,HTNV）、漢城病毒（Seoul virus,SEOV）、普馬拉病毒（Puumala virus,PUUV）、多不拉伐病毒（Dobrava virus,DOBV），引起漢坦病毒肺綜合征（HPS）的無名病毒（Sin Nombre virus,SNV）、紐約病毒（New York virus,NYV）、污黑小河溝病毒（Black Creek Canal virus,BCCNV）、牛軛湖病毒（Bayou virus,BAYV）、安第斯病毒（Andes virus,ANV）以及與人類疾病關系尚不清楚的一組病毒，如希望山病毒（Prospect Hill virus,PHV）、泰國病毒（Thailand virus,THAIV）、圖拉病毒（Tula virus,TULV）、索托帕拉雅病毒（Thottapalayam virus,TPMV）、哈巴羅夫斯基病毒（Khabarovsk virus,KBRV）、El Moro Canyon病毒（ELMCV）、Rio Segundo病毒（RIOSV）、島景病毒（Isla vista virus,ISLAV）、Muleshoe病毒（MULEV）、Bloodland lake病毒（BLLLV）、Rio Mamore病毒（RMV）、Topografov病毒（TOPV）等。