1、成人患者一般建議
用于治療成人患者（18歲及18歲以上的），輸注液須大約1小時的時間經靜脈緩慢地輸注。
2、經驗性治療
第一天單次70mg負荷劑量，隨后每天單次50mg。療程取決于病人的臨床反應。經驗治療需要持續至病人的中性粒細胞恢復正常。確診真菌感染的病人需要至少14天的療程；在中性粒細胞恢復正常和臨床癥狀消除后治療還需持續至少7天。如果50mg劑量耐受性好，但缺乏有效的臨床反應，可以將每天劑量升高至70mg。雖然尚無證據證明每天使用70mg劑量能夠提高療效，但現有的有限的安全性資料顯示每天劑量增加至70mg耐受性好。
3、侵襲性曲霉菌病
第一天給予單次70mg負荷劑量的注射用醋酸卡泊芬凈，隨后每天給予50mg的劑量。療程取決于病人疾病的嚴重程度、被抑制的免疫功能恢復情況以及對治療的臨床反應。雖然尚無證據證明使用更大的劑量能提高療效，但是現有的安全性資料提示，對于治療無臨床反應而對本品耐受性良好的病人可以考慮將每日劑量加大到70mg。
（1）對老年病人（65歲或以上）無需調整劑量。(見老年患者用藥)
（2）無需根據性別、種族或腎臟受損情況調整劑量。
（3）成人患者：當本品與具有代謝誘導作用的藥物依非韋倫、奈韋拉平、利福平、地塞米松、苯妥英或卡馬西平同時使用時，應考慮給予每日劑量70mg。
（4）肝臟功能不全的病人
對輕度肝臟功能不全(Child-Pugh 評分5至6)的成人患者無需調整劑量。但是對中等程度肝臟功能不全(Child-Pugh 評分7至9)的成人患者，推薦在給予首次 70mg負荷劑量之后，根據藥代動力學數據將本品的每日劑量調整為35mg。對嚴重肝臟功能不全(Child-Pugh 評分大于9）的成人患者和任何程度的肝臟功能不全兒童患者，目前尚無用藥的臨床經驗。
（5）兒童患者
在兒童患者（3個月至17歲）中，本品需要大約1小時的時間經靜脈緩慢地輸注給藥。兒童患者（3個月至17歲）的給藥劑量應當根據患者的體表面積（參見兒童用藥說明，Mosteller公式）。對于所有適應癥，第1天都應當給予70mg/m的單次負荷劑量（日實際劑量不超過70mg），之后給予50mg/m的日劑量（日實際劑量不超過70mg）。療程可以根據適應癥進行調整，各類適應癥的療程在成人中都有表述（參見成人患者用藥的一般建議）。
如果50mg/m的日劑量無法獲得足夠的臨床反應，但是患者又能很好地耐受，可以將日劑量增加到70 mg/m（日實際劑量不超過70mg）。盡管70mg/m的日劑量能否提高藥效尚缺乏證據，但是有限的安全性數據顯示，日劑量提升至70mg/m仍能被很好地耐受。
在兒童患者中，當本品和代謝誘導劑（如利福平、依非韋倫、奈韋拉平、苯妥英、地塞米松或卡馬西平）聯合使用時，本品的日劑量可調整到70mg/m（日實際劑量不超過70mg）。