LYH的診斷主要依賴病理學檢查。但可以根據病史、體格檢查、實驗室檢查和影像學表現推測LYH的診斷確診需要組織病理學（垂體活檢或手術切除標本）證據。在評價具有垂體功能異常的患者時如果存在以下3個或3個以上的情形時臨床上應考慮LYH的診斷：
1.女性（懷孕期間）
2.年輕（特別是小于30歲）
3.單純、早發的ACTH和/或TSH缺乏；垂體前葉功能異常與MRI改變不成比例 。
4.其它自身免疫性疾病和/或自身抗體陽性（TG、TM、ANA、抗平滑肌抗體）。
5.急性發作的頭疼、 眼肌麻痹、視野異常、惡心、嘔吐。垂體卒中也可以有相似的癥狀但病情往往更加危重MRI表現為出血征象。當然LYH也有發生卒中的可能。
6.急性發病的CDI同時伴有明顯的頭疼及其它腫塊占位性癥狀。而肉芽腫和侵潤性疾病如結節病、組織細胞增生癥等雖然也有類似癥狀但往往起病比較隱匿。
7.血清抗垂體抗體陽性。
8.無腦膜炎和抗病毒抗體的情況下CSF中出現多形淋巴和單核細胞
9.典型的MRI表現：a. LAH 和LPH: (i) 鞍內腫塊明顯強化(（呈“三角形”和/或累及鞍隔)）或 (ii)彌漫性、邊界不清、對稱性垂體增大； (iii)向鞍上延伸特別是“舌狀” 延伸； (iv)動態MRI顯像示上述征象完全強化時間延遲(（>90 sec.)）。b. LINH (（和LPH)）:(i) 垂體柄彌漫性增粗增強掃描后可以強化也可以不被強化； (ii) T1加權像后葉高信號消失。
盡管目前大多數學者認為LYH的確診需要病理學證據但目前已經有不少病例采取保守治療的策略取得了滿意的效果而且垂體活檢或手術帶來的危險促使我們需要確立臨床診斷標準從而避免這些“有創”的診斷措施。目前歐美許多研究者認為大多數疑診為LYH的患者伴有明顯的激素分泌異常和/或腫塊效應相關的癥狀時確診不必需要組織學證據。有些病例中也許經蝶立體定位垂體活檢是LYH的診斷有用的手段但這個方法常常由于不能從真正的病變部位獲得組織而導致誤診。