混合性厭氧菌感染指數以百計的存在于皮膚、口腔、腸道和陰道的非產芽胞的正常厭氧菌群和需氧菌群的共生關系遭到破壞（例如外科手術或其他創傷、血液供應差或組織壞死），其中的某些菌種可引起伴有高發病率和高死亡率的感染，經這些途徑進入人體后可隨血流擴散至遠處。因為需氧和厭氧菌常可發現于同一感染部位，因此感染可能是混合性的，除非用適當的辦法進行分離和培養，厭氧菌可能被忽視。然而厭氧菌可能是胸膜腔和肺、腹腔內、婦科、中樞神經系統、上呼吸道感染和皮膚疾病及菌血癥的主要病原菌。厭氧菌和需氧菌混合性感染率很高。
