為了顯示與確定組織或細胞中的正常結構或病理過程中出現的異常物質、病變及病原體等，需要分別選用相應的顯示這些成分的染色方法進行染色。包括：膠原纖維染色（Masson等）、網狀纖維染色、彈力纖維染色、肌肉組織染色（磷鎢酸蘇木素）、脂肪染色（蘇丹III）、糖原染色（PAS）、粘液染色（PAS）等。
Masson三色染色：膠原纖維藍色（苯胺藍復染）或綠色（亮綠復染），肌纖維、纖維素紅色，紅細胞呈橘紅色。
