登革病毒易發生變異。病毒核苷酸序列分析結果表明相同血清型病毒中不同分離株間的核苷酸變異為10%，而不同血清型病毒間的核苷酸變異為30%。并且根據病毒寡核苷酸指紋圖譜的同源程度，可以將同型病毒的不同毒株分為不同的拓撲型。由病毒變異后所形成的新的登革病毒毒株常常可引起地區性登革熱的爆發流行。抵抗力 病毒對熱敏感，56℃30分鐘可以滅活。氯仿、丙酮等脂溶劑、脂酶或去氧膽酸鈉可以通過破壞病毒包膜而滅活登革病毒。病毒經去垢劑處理后釋放出的病毒核酸可以被核酸酶迅速降解。病毒對胃酸、膽汁和蛋白酶均敏感。對紫外線、γ射線敏感。酒精、1%碘酒、2%戊二醛、2%～3%過氧化氫、3%～8%甲醛等消毒劑可以滅活登革病毒。