黏膜疾病的實驗室檢查有多種,要結合病因考慮,如感染性疾病可借助細菌學檢查,病毒性疾病可進行病毒培養鑒定,組織病理可為腫瘤提供診斷依據。性傳播疾病也有多方面檢查,如梅毒血清學試驗,PCR檢查可以用于多種疾病的診斷,真菌學檢查有助于真菌性疾病的診斷。