真菌孢子是真菌的主要繁殖器官。真菌孢子分為有性孢子和無性孢子兩大類，前者通過兩個細胞融合和基因組交換后形成，后者無此階段而經菌絲分裂等形成。孢子在適宜條件下發芽，形成菌絲而進行分裂繁殖； 當外界環境不適宜時可以呈休眠狀態而生存很長時間。
真菌是廣泛存在于自然界的一類真核細胞生物,具有真正的細胞核和細胞器,不含葉綠素,以寄生和腐生方式吸取營養,估計全世界已記載的真菌有10萬種以上,其中絕多數對人類無害,只有少數真菌（約200余種）與人類疾病有關。真菌最適宜的生長條件為溫度25℃～28℃（絲狀真菌）或37℃（酵母型和類酵母型真菌）濕度95%～100%,pH 4.0～6.0。真菌不耐熱,100℃時大部分真菌在短時間內死亡,但低溫條件下可長期存活；紫外線不可以殺死真菌,甲醛,石炭酸,碘酊和過氧乙酸等化學消毒劑需要一定達到一定濃度后均能迅速殺滅真菌。
按照菌落形態,真菌可分為酵母菌和霉菌兩大類,前者菌落呈乳酪樣,由孢子和芽生孢子組成,后者菌落呈毛樣,由菌絲組成,故又稱為絲狀真菌。有的致病真菌在自然界或25℃培養時呈菌絲形態,而在組織中或在37℃培養時則呈酵母形態,稱為雙相真菌。