已有近50年的歷史，由于其設備十分簡單、價廉，所需樣品少，分辨力一般能達到要求等優點而被廣泛應用。紙上分配層析可用于物質的分離、定性及定量，對氨基酸、肽類、核苷及核苷酸、糖、維生素、抗生素、有機酸等小分子物質都很適用，但對核酸和蛋白質大分子的分辨力不高。在發酵工業中，常用于菌種篩選階段的物質鑒定。
