肺部厭氧菌感染的預后取決于患者的全身狀況、感染類型和治療是否及時。老年、全身衰竭、壞死性肺炎和支氣管阻塞均為預后不良的決定因素。一般社區獲得性厭氧菌肺炎的預后是良好的。醫院內獲得性厭氧菌肺炎患者因多有基礎病，常繼發革蘭陰性菌感染，故預后不良，病死率可達5%～12%。
