1.部分性癲癇 感覺異常、抽搐，癥狀常按皮質功能區擴展，腦電圖可有局限性異常癇性放電，頭部CT或MRI可發現腦內局限性病灶，抗癲癇治療有效。
2.梅尼埃綜合征 以眩暈發作為主，易與椎-基底動脈系統TIA混淆。但患者較年輕，發作時間長，多伴有耳鳴，多次發作后聽力下降，甚至耳聾。不伴有腦干定位體征。
3.偏頭痛 青年人多見，以反復發作的搏動性頭痛為特征，多伴有惡心，嘔吐，發作前可有視覺先兆，有時可能有運動障礙和情緒改變，發作持續時間可超過24h。
4.暈厥 多在直立位置水平位后，發作時面色蒼白、出冷汗、意識喪失、脈搏沉細、血壓降下降。當病人身體置水平位后，脈搏即可有力，面色轉紅，意識恢復，發生原因多與迷走神經興奮性增高，體位性低血壓或強烈的情緒因素有關。
5.心臟病 腦動脈硬化病人合并有冠狀動脈粥樣硬化性心臟病、心律失常、心肌梗死伴血壓過低，心力衰竭等可與短暫性腦缺血發作相混淆。但只要同時注意脈搏、血壓、心臟情況和心電圖檢查，即很容易診斷。