結節病的病程一般呈良性經過，預后較好，約75%患者自行緩解，20%～25%患者出現肺功能永久性損害，5%～10%死亡。死亡原因多為肺纖維化導致的呼吸衰竭和肺心病。據文獻報道，胸內結節病Ⅰ期損害，病變在2年內自行消退者約占80%，Ⅱ期為65%，Ⅲ期為30%。一般認為，胸內結節病病變在診斷后1年內治療者預后較好，病程超過2年者，治療效果較差，因此應盡量爭取早期治療。結節病急性起病伴有結節性紅斑及關節炎癥者預后較好，自然緩解率高，而伴有肝臟腫大、中樞神經系統病變、心臟病變、上呼吸道炎癥、凍瘡樣狼瘡、腎臟鈣質沉著癥或肺心病者預后較差，自然緩解率多在25%以下。