幽門螺旋桿菌感染檢測有許多方法，如活組織鏡檢、幽門螺旋桿菌的分離培養、快速尿素酶試驗、尿素呼氣試驗、尿氨排出試驗、血清學試驗以及多聚酶鏈反應等。不同醫院采用的方法不同，但大多數醫院采用的方法都是特異、快速的，有些是無創傷的。專家們告誡患者，如感覺胃部不適，應該去作幽門螺旋桿菌感染檢查，以便及早用藥，及早從消化道清除：狗胃螺旋菌（Gastrospirillum canine, Gc），幽門彎曲桿菌（Campylobacter，pylori），幽門螺桿菌（Helicobacter pylori, HP），豬胃螺旋菌（Gastrospirillum suis，G. suis），等菌群，以防止發展成嚴重的胃部疾病。
1、金標尿素酶檢測
抗原標本為糞便，抗體標本為血液、血清、指尖血。特點是方便、快捷、15分鐘出結果，且不受許多條件的限制。檢測結果為繼往感染。
2、碳13呼氣試驗
檢測須在空腹狀態或者餐后兩小時后進行，患者近一月內未服用抗生素、鉍制劑、質子泵抑制劑等Hp敏感藥物，否則會造成檢測結果假陰性。收費較高。
3、碳14呼吸試驗
C14呼氣試驗是臨床用于檢測幽門螺桿菌感染的一種方法。被檢者空腹，用約20ml涼開水口服一粒尿素[14C]膠囊，靜坐25分鐘后，用一次性吹氣管向二氧化碳吸收劑中吹氣，再將吹完氣的樣品交給醫生做檢測，檢測就完成了。2003年國家環境保護總局辦公廳已批準尿素碳14膠囊用于檢測幽門螺桿菌感染體內診斷的放射性豁免。 [12] 2011年國家藥監局頒布復函：對于使用尿素碳14呼氣試驗藥盒的醫療機構無需持有《放射性藥品使用許可證》。
4、快速尿素酶法
臨床上應用最廣的方法。能直觀有效觀察患者是否感染HP.快速，安全，準確，臨床檢測操作方便，無放射性，收費較低。適用于首次胃鏡檢查。有創檢查，不適合復查。