急性潰瘍穿孔主要原因是活動性潰瘍基底組織壞死，穿透漿膜層，致胃腔與腹腔相通。潰瘍穿孔后，含有食物、胃液、膽汁、胰液等胃十二指腸內容物流入腹腔，首先胃酸、膽汁等刺激引起化學性腹膜炎，產生劇烈的持續性腹痛。數小時后，胃腸內容物流出減少，而腹膜刺激所致滲出液增加，胃腸流出物被稀釋，腹痛可暫時減輕。一般于8~12小時后，由于腹腔內細菌的生長和繁殖，形成細菌性腹膜炎，引起腸麻痹、敗血癥及中毒性休克。慢性穿孔時因潰瘍在向深部發展時，多逐漸與周圍組織形成粘連，表現為慢性穿透性潰瘍、胃膽囊瘺或十二指腸膽囊瘺。
