HMGCoA還原酶在胞液中經蛋白激酶催化發生磷酸化喪失活性，而在磷蛋白磷酸酶作用下又可以脫去磷酸恢復酶活性，胰高血糖素等通過第二信使cAMP影響蛋白激酶，加速HMGCoA還原酶磷酸化失活，從而抑制此酶，減少膽固醇合成。胰島素能促進酶的脫磷酸作用，使酶活性增加，則有利于膽固醇合成。此外，胰島素還能誘導HMGCoA還原酶的合成，從而增加膽固醇合成。甲狀腺素亦可促進該酶的合成，使膽固醇合成增多，但其同時又促進膽固醇轉變為膽汁酸，增加膽固醇的轉化，而且此作用強于前者，故當甲狀腺機能亢進時，患者血清膽固醇含量反而下降。