病因尚不清楚，可能與以下因素有關:
1.胰腺囊腺癌與吸煙之間有密切聯系。吸煙引起胰腺囊腺癌的可能機制：①吸煙促使致癌物質煙草特異性N-亞硝酸鹽分泌到膽管，隨后反流入胰管；②煙草特異性N-亞硝酸鹽對器官的特異性作用可隨血流入胰腺；③吸煙增加血脂水平，促發胰腺癌。吸煙者可能因細胞甲基化水平低而易致癌。
2.不同種族飲酒后其胰腺囊腺癌發病率亦有不同。
3.有報道胰島素在體外或體內能促使胰腺囊腺癌細胞生長。
4.研究支持慢性胰腺炎可以發展為胰腺囊腺癌。
5.幽門螺桿菌（Hp）研究顯示，胰腺囊腺癌患者中有Hp血清陽性結果，提示Hp感染與胰腺囊腺癌有相關性。
6.有研究顯示，常規服用阿司匹林，胰腺囊腺癌發病風險可能增大。
7.咖啡能使患胰腺囊腺癌的危險增加4倍。研究證明，咖啡可以抑制DNA修復，并在DNA復制完成前誘導有絲分裂過程，是其致癌的主要原因。