1.實驗室檢查
血常規可表現為白細胞計數增高，尤其在繼發感染時更加明顯。有時血糖也升高，尿糖陽性。大便中出現油滴，表示胰腺外分泌功能不足。在囊腫病例中，血清胰蛋白酶和血漿抗凝血酶也常可明顯升高，有助于胰腺囊腫的早期診斷。
2.其他輔助檢查
（1）X線檢查
①腹部平片 對于大的囊腫，腹部平片可顯示軟組織塊影。少數病人可顯示胰腺或囊腫的鈣化影，呈斑片狀，是胰腺炎并發的胰腺結石或鈣化所致。
②胃腸道鋇劑造影 包括上消化道鋇餐造影和鋇劑灌腸造影兩種方法，可有約80%的病例為陽性表現。主要表現為囊腫對胃的壓迫和推移，其次是對十二指腸、十二指腸空腸曲、橫結腸、結腸脾曲和降結腸等的壓迫和推移。據此可間接判斷囊腫的位置、大小，形態以及與胰腺的關系。
③胰管造影 胰管造影的方法較多，目前應用的有內鏡逆行胰膽管造影（ERCP）、術中胰管造影（OPT）、經引流管胰管造影、和經皮經肝穿刺膽管造影（PFC）等。ERCP只能顯示胰管受壓、移位和狹窄以及囊腫與胰管是否相通等表現，不能為囊腫的診斷提供更多的征象。OPT近年來應用增多，主要用于胰腺內較小囊腫的診斷。
④血管造影 選擇性腹腔動脈和腸系膜上動脈造影，可顯示動脈及其分支受壓、移位，在囊腫周圍呈現一血管“抱球”征象，血管稀疏拉直，囊內無血管分布是其特點。
（2）超聲波檢查 B超是臨床上常用的首選檢查方法，對胰腺囊腫的診斷正確率高達90%。B超可探知胰腺囊腫的部位、大小、囊壁的厚度以及囊腫的多少。較大囊腫往往擠壓周圍組織，使之受壓而移位。
（3）CT檢查 CT能準確地顯示胰腺囊腫的部位、大小，測定囊壁的厚度、囊內容物的密度，探知有無囊內間隔或囊內新生物，了解囊腫與周圍臟器、重要血管的相互關系，能為診斷和治療提供充分的參考資料。
（4）B超或CT引導下的穿刺活檢術 在胰腺囊腫診斷基本明確后，還須鑒別囊腫的性質。單純依靠影像學技術往往難以作出鑒別，而對胰腺囊腫的穿刺活檢術則可為鑒別診斷提供有力的幫助。