脂肪酸合成酶是一個具有多種功能的酶系統,在低等生物中,脂肪酸合成酶系是一種由1分子脂酰基載體蛋白(ACP)和7種酶單體所構成的多酶復合體;但在高等動物中,則是由一條多肽鏈構成的多功能酶,通常以二聚體形式存在,每個亞基都含有一ACP結構域。在脂肪酸合成酶中,底物和中間產物分子在各個功能結構域(可以位于同一酶分子,也可以位于不同酶分子)中傳遞直到完成脂肪酸的整個合成過程。