去除病因后，行靶腺激素的長期替代治療。
1.腎上腺皮質激素
是治療全垂體前葉功能減退的首要治療，要先于甲狀腺激素和性激素的替代。首選氫化可的松（皮質醇）或可的松（皮質素）或潑尼松（強的松），服用原則為最小有效替代劑量。嚴重感染、大手術等嚴重應激時，可予氫化可的松靜滴，避免發生危象。
2.甲狀腺激素
小劑量開始逐步加量至最小有效替代量。在補充腎上腺皮質激素1～2周后，可予以補充甲狀腺素（L-T4），或使用干甲狀腺片，逐漸加至維持量。劑量較大時可分次服用，對冠心病，心肌缺血患者或老年患者更應注意從小劑量開始緩慢加量。
3.性激素
（1）生育期婦女應建立人工周期，恢復第二性征和性功能，防止骨質疏松。
（2）男性使用雄激素替代治療，以維持第二性征和性欲。
4.其他治療
包括兒童在骨骺愈合前可使用生長激素及一般對癥治療等。