1.慢性腎小球腎炎繼發高血壓 若病史十分清楚則鑒別毫無困難，慢性腎小球腎炎患者尿異常在前，高血壓在后；而良性小動脈性腎硬化癥患者高血壓則先于腎損害10余年。對于病史不清，尤其已有腎功能不全的病例，鑒別常很困難，此時表1中資料可作鑒別參考。
2.慢性腎盂腎炎繼發高血壓 患者多為女性，常有間歇發作的泌尿系刺激征，尿化驗白細胞增多，細菌培養陽性，而后出現腎功能損害(腎小管功能損害常較腎小球功能損害明顯)及高血壓。腎盂造影顯示患側腎臟形態異常，出現腎皮質瘢痕和(或)腎盞擴張、變形。由于慢性腎盂腎炎多為單側腎臟疾患，故B超檢查兩腎大小常不相等，患側腎臟變小；核素腎動態顯像檢查兩腎腎小球濾過率及腎圖也常不一致，患側腎功能差。泌尿系感染史、高血壓出現在尿異常后以及兩腎影像及功能不一致等特點，均能與良性小動脈性腎硬化癥鑒別。
3.腎動脈狹窄繼發高血壓 腎動脈狹窄多由大動脈炎、纖維肌性發育異常或動脈粥樣硬化引起，前二者好發于青年，后者中老年多見。患者常出現嚴重高血壓，達200/120mmHg以上，舒張壓升高明顯，而后出現輕度尿異常(輕度尿蛋白及有形成分)，最后腎功能漸進減退。患者腹部有時可聞及收縮期或雙期雜音。B超檢查患側腎臟縮小，腎靜脈血化驗患側腎素活性增高，卡托普利核素腎圖檢查陽性，腎動脈造影發現主干或分支狹窄即可將本病確診。高血壓程度嚴重，腎臟損害出現較早，兩腎影像及功能不一致，均與良性小動脈性腎硬化癥不同，而腎動脈造影更能確切將兩病鑒別。