trp操縱子轉錄終止的調控是通過弱化作用(attenuation)實現的。在大腸桿菌trp operon,前導區的堿基序列包括4個分別以1、2、3和4表示的片段,能以兩種不同的方式進行堿基配對,1 -2和3 -4配對,或2 -3配對,3 -4配對區正好位于終止密碼子的識別區。前導序列有相鄰的兩個色氨酸密碼子,當培養基中Trp 濃度很低時,負載有Trp 的tRNATrp也就少,這樣翻譯通過兩個相鄰色氨酸密碼子的速度就會很慢,當4區被轉錄完成時,核糖體滯留1區,這時的前導區結構是2 -3配對,不形成3 -4配對的終止結構,所以轉錄可繼續進行。反之,核糖體可順利通過兩個相鄰的色氨酸密碼子,在4區被轉錄之前,核糖體就到達2區,這樣使2 -3不能配對,3 -4 區可以配對形成終止子結構,轉錄停止。
枯草桿菌的弱化作用機制另有特點。因其色氨酸操縱子結構的特殊性,轉錄起始的調節似乎不如轉錄終止的調節更具重要性。枯草桿菌色氨酸操縱子表達主要受到色氨酸激活RNA結合蛋白(Trp -activated RNA -binding p rotein,TRAP)的調節。該蛋白與色氨酸結合被激活后,可與trpE上游轉錄產物結合,導致轉錄終止。當色氨酸濃度較低時,TRAP失活,轉錄可以繼續,結構基因得以表達。另外枯草桿菌對未負荷色氨酸的tRNATrp也很敏感,后者大量堆積,會誘導合成抗TRAP 蛋白(anti -PRAP,AT)。AT與Trp激活的PRAP結合,可以取消其轉錄終止活性。trpG表達也受PRAP調控,活化的TRAP與和trpG相重疊的S -D 序列結合,阻礙核糖體的結合,抑制trpG轉錄。