這種折磨人的慢性病病因未明，有人懷疑病因是一種病毒、細菌或變了質的免疫反應。此病患者多在十至四十歲之間，很可能是歐洲人或有猶太血統的人，或是家人曾患此病者。
從X射線照片可見，紅腫發炎的腸管粗厚充血，像嵌滿了斑駁的鵝卵石，因為多個小潰瘍已經穿透腸壁。這種炎癥可導致腸腔狹窄，引起痙攣和疼痛。患者常有腹瀉兼腹部觸痛，糞便可能帶血和帶粘液。
因為節段性回腸炎影響到人體多個系統，所以最初的癥狀似乎與這種病無關。諸如視覺障礙、皮膚損傷和潰瘍、發育障礙、口腔潰瘍以及肌肉疼痛，都是節段性回腸炎的征兆。精神上和肉體上的折磨常使患者精疲力竭。這些癥狀有時令患者非常焦慮。以致發生精神障礙。為預防這些不愉快的事情，醫生多半先把各種癥狀告訴患者，讓患者懂如何應付這種病。
至今仍然無法根治節段性回腸炎。所謂治療旨在減輕患者的癥狀，并在出現各種并發癥時加以治療。醫生會定期一系列試驗，觀察病情有否惡化，如何惡化。為了先發制病，診治并發癥和盡可能預防并發癥，這樣的試驗檢查是絕對必要的。
患者主要依靠藥物治療，可服用止瀉藥以減少炎癥發作， 可能還得短期服用類固醇。盡管經常采用外科手術，醫生其實是不愿意這樣的，因為這種病具有頑固的復發傾向。
雖然患者遭受很多痛苦，但是節段性回腸炎通常不危及生命；患者知道這點，也許會稍微得到些安慰。這種病的療法正在不斷改進，日后必定有更大進展。