血管角化瘤因缺乏α-半乳糖甙酶而發病。本病為伴性隱性遺傳，確切的發病機制還缺乏證據，但可以確定，肢端型與凍瘡或其他原因引起的血管損傷有關。陰囊型與外傷或手術后局部血管內壓力增高有關，丘疹型多發下肢，與局部靜脈壁彈性組織的先天缺陷有關。界限型有時伴有其他類型的血管畸形，因與先天因素有關。而泛發型則有所不同，目前認為是先天性某些酶的缺陷導致代謝障礙，血管壁發生異常。可見于先基鞘氨醇已糖苷酶缺乏癥、墨角藻糖苷酶缺乏病、半乳糖唾液酸沉積癥、Kanzaki病、β甘露糖苷過多癥、天冬氨酰葡糖胺尿癥的患者。
