衣原體是介于細菌和病毒之間的微生物。它寄生于人體細胞內，含脫氧核糖核酸和核糖核酸。在其生活周期中，有原體和始體兩種形態。原體體積較小（直徑為200 ~ 300nm），細胞質致密，具有高度傳染性。它進入敏感細胞后，體積變大（直徑可達800^1 200nm），成為始體，細胞漿變得疏松或呈網狀，因而始體又稱為網狀體，沒有傳染性但具有新陳代謝活性，在宿主細胞內行二分裂繁殖。衣原體有15個血清型，其中A,B,Ba和C型引起沙眼,D,E,F,G,H,I,J及K型引起尿道炎、附肇炎、前列腺炎、直腸炎、宮頸炎、輸卵管炎、盆腔炎、肝周炎和Re-iter病，L1,L2和L3型引起性病性淋巴肉芽腫。衣原體對熱敏感，56一60℃僅能存活5 ^ -l0min，但能耐低溫，在冷凍條件下存活數年。中科院微生所測試含PHMB殺菌成分的嬌妍潔陰洗液可將其迅速殺死，證明衣原體對PHMB等殺菌制劑耐受力弱。
根據許多國家報告，NGU中30%-50%，淋病病人中20%和性活動強但無尿道炎癥狀的人中0.5%，以目前常用的培養方法，尿道分泌物可培養出衣原體。女性病人因多數無癥狀或僅表現為白帶增多等婦科癥狀，難以確定其發病率，有人估計女性病人可能為男性的4倍。衣原體是一種寄附于腺上皮細胞胞漿內的微生物。呈球型，有特殊的生長周期。每個生長周期有兩種發育型。 感染型為原體(elementary body)呈球形，大小介于細菌與病毒之間(300-400mm)。原體可在細胞外生存，有感染性 。當其附著在易感細胞表面時，被細胞吞飲，在細胞內原體變成另一種繁殖型。繁殖型即始體(initial body)始體呈圓形或橢圓形。始體按二分裂方式繁殖，最后始體重新組織成原體，從細胞內釋放出來，再感染其他健康易感細胞。整個生長周期為72h。
衣原體分類：
1、鸚鵡熱衣原體。
2、沙眼衣原體(Chlamydia trachomatis) 沙眼衣原體至少有15個血清型。D-K8種血清型與NGU有關。L1、L2、L33個型與性病性淋巴肉芽腫(第四性病)有關。