諾如病毒為無包膜單股正鏈RNA病毒，病毒粒子直徑約27-40nm，基因組全長約7.5-7.7kb，分為三個開放閱讀框（Open Reading Frames, ORFs），兩端是5'和3'非翻譯區（Untranslated region, UTR），3'末端有多聚腺苷酸尾（PolyA）。ORF1編碼一個聚蛋白，翻譯后被裂解為與復制相關的7個非結構蛋白（Non-structural polyprotein），其中包括RNA依賴的RNA聚合酶（RNA dependent RNA polymerase, RdRp）。ORF2和ORF3分別編碼主要結構蛋白（VP1）和次要結構蛋白（VP2）。病毒衣殼由180個VP1和幾個VP2分子構成，180個衣殼蛋白首先構成90個二聚體，然后形成二十面體對稱的病毒粒子。根據蛋白在衣殼中的位置，每個衣殼蛋白可分為兩個主要區域，分別為殼區（Shell domain，S區）和突出區（Protruding domain，P區），二者之間是由8個氨基酸組成的鉸鏈區（Hinge）連接。S區由衣殼蛋白的前225個氨基酸組成，形成病毒內殼，圍繞病毒RNA。P區由剩余的氨基酸組成，進一步分為兩個亞區P1區和P2區。P區通過二聚體相互作用增加衣殼穩定性并形成電鏡下可見的病毒粒子突出端。P2區高度變異，包含潛在的抗原中和位點和受體組織血型抗原（histoblood group antigens, HBGAs）識別位點。VP2位于病毒粒子內部，被認為參與衣殼聚集 [6] 。