由于敗血癥絕大多數繼發于各種感染，又缺乏特異的臨床表現，故易造成漏診或誤診。為提高敗血癥的早期確診率應及時進行相應檢查。
白細胞總數及中性粒細胞升高，近期有呼吸道、消化道、尿路感染或燒傷、器械操作史，以及各種局灶性感染雖經抗菌治療而未能獲有效控制者，均應高度懷疑有敗血癥可能。血培養是敗血癥最可靠的診斷依據。血培養陰性而骨髓培養陽性，則其意義與血培養陽性相同。其他如痰、尿、胸水、腹水、膿性分泌物等的培養對明確診斷均有參考意義。檢測血液、尿液、胸腹水等標本中有無內毒素，以證實是否為革蘭陰性菌感染。在病程中出現眼結膜、口腔黏膜等瘀點、皮疹、肝脾大、遷徙性損害或膿腫，敗血癥之診斷也可基本成立。