根據遺傳方式、萎縮肌肉分布特征可將進行性肌營養不良癥分為七類：
1、假肥大型肌營養不良
最多見。現在亦被稱為抗肌萎縮蛋白缺陷型肌營養不良，又分為Duchenne型（Duchenne muscular dystrophy, DMD）和Becker型(Becker muscular dystrophy, BMD)，前者發病率約為1/3500活產男嬰，后者發病率較低，約為1/20，000。。其他因抗肌萎縮蛋白缺陷引起的肌病包括X連鎖擴張型心肌病、肌痛肌痙攣綜合征、女性肌營養不良癥等。
2、肢帶型肌營養不良
肢帶型肌營養不良（limb girdle muscular dystrophy, LGMD）是一組臨床表現和遺傳特點不同的異質性肌病，分為常染色體顯性遺傳和常染色體隱性遺傳兩大類型，稱為LGMD1和LGMD2，在此基礎上根據致病基因和缺陷蛋白又分為若干亞型，分別命名為LGMD1A、1B、1C和2A、2B、2C…等。
3、面肩肱型肌營養不良
面肩肱型肌營養不良（facioscapulohumeral musculardystrophy, FSHD）為常染色體顯性遺傳，發病率約為1～5/10～20萬。
4、Emery-Dreifuss肌營養不良
主要是性連鎖隱性遺傳，少數可為常染色體顯性或隱性遺傳，分別稱為EDMD1、EDMD2和EDMD3型。
5、遠端型肌營養不良
根據遺傳方式、基因定位、臨床上是以手肌、脛前肌為主，還是腓腸肌為主，將遠端型肌營養不良又分為多個亞型，在40歲前起病的Welander型、Markesberry-Grigg-Udd型，在40歲以后起病的Nonaka型、Miyoshi型和Laing型。
6、眼咽型肌營養不良
眼咽型肌營養不良(oculopharyngeal muscular dystrophy, OPMD)，較少見，常染色體顯性或隱性遺傳，或為散發。
7、先天型肌營養不良
先天型肌營養不良（congenital muscular dystrophy, CMD）根據臨床表現、基因和生化缺陷被分為10多個類型。